Biokemija vaja 2010

mutacija-gena-biokemija-in-biofizikaKAJ JE MUTACIJA?

Mutacija je napaka pri replikaciji DNA. V ekson se vgradi napačen nukleotid. Posledica je  prenos napačne informacije. Na eksonu  – sprememba AK zaporedja, sinteza napačnega proteina – protein ne bo več pravilno deloval. Na intronu  je tiha mutacija – naj nebi imelo vpliva.


NAŠTEJ VLOGO VODE V CELICI!

Vloga vode v celici:Je topilo in reaktant,Uravnava telesno temperaturo,Uravnava koncentracijo vodikovih ionov in pH,Je glavna sestavina večine bioloških molekul,Je reducent,Je produkt OKSIREDUKCIJSKIH REAKCIJ


RAZLIKA MED POLARNO IN NEPOLARNO SKUPINO!

Polarne spojine so hidrofilne in so dobro topne v vodi ( alkoholi, amini, amidi, etri ). Polarna skupina tvori H – vezi z vodo. Nepolarne spojine so hidrofobne in niso topne v vodi (benzen)


TRANSPORTNE OBLIKE HOLESTEROLA V KRVI !

LDL ( LIPOPROTEINI majhne gostote ) so glavni prenašalci holesterola po krvi iz jeter do

perifernih tkiv.HDL ( LIPOPROTEINI velike gostote ) prenašajo kri iz perifernih tkiv v jetra – dober holesterol.

Poznamo PROSTI in ZAESTRENI holesterol.


NAPIŠI FORMULE ZA:

ETANOL = C2H5OH,METAN = CH4,AMONIAK = NH3

AMONIJEVA BAZA = NH4OH ( NH3 + H2O   =!!!!     NH4+ + OH),

DUŠIK = N2

SOLNA KISLINA = HCl


KAJ JE ESTERIFIKACIJA?

ESTERIFIKACIJA je kadar se hidroksilna skupina ( alkohol ) poveže z maščobno kislino z

estersko vezjo. Proces lahko poteče postopoma – nastanejo vmesni MONOACILGLICEROLI

ali DIACILGLICEROLI. Produkt sta ESTER in VODA.


NORMALNE VREDNOSTI HEMOGLOBINA PRI ŽENSKI IN MOŠKEM!

Normalna vrednost hemoglobina pri ženski je 120 – 160 g/L, pri moškem pa 120 – 180g/L.


KAJ JE GORIŠČE LEČE POD MIKROSKOPOM?

Točke v kateri optična os prebode goriščno ravnino imenujemo GORIŠČE.


NAŠTEJ DELE MIKROSKOPA!

Ločimo mehanske in optične dele. Optični so:okular,objektiv,kondenzor,,kolektor, svetilo


KAJ JE DIOPTRIJA?

Dioptrija je enota za lomnost leče.


KAJ SO RIBOSOMI?

Je celični organel, ki katalizira in regulira tvorbo proteinov. Sestavljen je iz RNA in RIBOSOMSKIH PROTEINOV.


ZAKAJ NOSI INFORMACIJO RNA?

RNA nosi informacijo za sintezo proteinov.


NAPIŠI STRUKTURO MICELA!

MICEL je sestavljen iz natrijevega stearat – a, ki je KARBOKSILATNI ANION in ima NEPOLARNI OGLJIKOVODIKOV KONEC ter VODE.

DISOCIACIJA KISLINE V VODI!

HA             –            H+ +                A

KISLINA                                                   BAZA


NAŠTEJ 7 ENCIMOV!AST,ALT,LDH,ALKALNA FOSFATAZA,LIPAZA,DNA POLIMERAZA,TRIPSIN,RIBONUKLEAZA,RNA POLIMERAZA


KAJ SO RIBOCIMI?

Ribocimi so molekule katalitične RNA, ki delujejo kot encimi. Molekula ima katalitične in encimske lastnosti. Poznamo:

RIBONUKLEAZA P – lahko cepi Trna,SAMOIZREZUJOČI INTRONI RNA

KAKO DELUJEJO INHIBITORJI ENCIMOV?

IREVERZIBILNI INHIBITOR = se poveže z encimom s kovalentnimi ali zelo močnimi vezmi. Veže se na funkcionalno skupino AK, ki sodeluje pri vezavi substrata ali pri katalitičnem delovanju, ter tako inaktivira encim ( BOJNI STRUPI – ŠKODLJIVI; ASPIRIN inhibira sintezo prostaglandinov – BOLEČINA )

REVERZIBILNI INHIBITOR = veže se na encim, vendar lahko iz njega disocirajo – ENCIM je neaktiven le takrat, ko je inhibitor nanj vezan. Poznamo 3 skupine:

KOMPETITIVNE,NEKOMPETITIVNE,AKOMPETITIVNE


NAŠTEJ GLAVNE GRUPE ENCIMOV PO KLASIFIKACIJI!

Glavne grupe encimov so:OKSIDOREDUKTAZE,TRANSFERAZE,HIDROLAZE,

LIAZE,IZOMERAZE,LIGAZE


KAJ SO AMINOTRANSFERAZE?

Aminotransferaze so podskupina transferaz, ki katalizirajo TRANSAMINACIJO. Transferaze so encimi, ki katalizirajo prenos funkcionalne skupine z ene molekule na drugo. Transaminacija je reakcija v kateri se aminska skupina z ene AK prenese na alfa ketokislino = katalizirajo jo AMINOTRANSFERAZE.


KATERO HIDROLIZO POZNAŠ?

HIDROLIZA je cepitev vezi. Pomeni, da polimer ob prisotnosti H2O razpade na monomere. Poznamo:ESTROV ( LIPAZA ),AMIDOV ( KARBOKSI – PEPTIDAZA )

GLUKOZIDOV ( LAKTAZA )


KAKO SE HILOMIKRONI TRANSPORTIRAJO V KRVNEM OBTOKU?

V črevesu se sestavijo iz lipidov iz hrane, se absorbirajo in preko limfe izločijo v kri, po kateri se prenesejo do perifernih tkiv. Tam lipaza sprosti MK iz triacilglicerolov ( TAG ). Lipoprotein izgubi večino TAG ostane hilomikronski ostanek, ki je bogat s holesterolom.


KATERE VRSTE HOLESTEROLA POZNAMO?

Poznamo prosti in zaestreni holesterol.


KAJ SO PEKTINI?

Pektini so polisaharidne komponente celičnih sten. Estrahiramo jih iz rastlin.


KAJ SO FOSFOLIPIDI?

FOSFOLIPIDI so polarni lipidi, ki so po zgradbi podobni TAG, le da imajo namesto treh radikalov MK na glicerol zaestreni le dve na tretjo pa je zaestrena polarna glava. Pri fosfolipidih je to fosforjeva ( V ) kislina, nanjo pa je vezan še drug alkohol. Glava je polarna, rep pa nepolaren.


V KATERIH STRUKTURAH SO ZASTOPANI FOSFOLIPIDI?

so del lipidnega dvosloja celične membrane,so poglavitni gradniki celičnih membran


KAJ JE CIKLIČNI ADENOZIN MONOFOSFAT?

cAMP je oblika adenozin monofosfata, v kateri sta hidroksilni skupini na mestih 3´ in 5´ povezani v ciklični fosfodiester in deluje kot sekundarni obveščevalec.


KAJ JE BISTVENA KEMIJSKA LASTNOST NENASIČENIH MK?

Zanje je značilna reaktivnost molekul, ki imajo dvojne vezi v CIS konfiguraciji med dvema ogljikoma.


KAJ SO 3 – GLICERIDI?

3 – GLICERIDI so estri alkohola glicerola in višjih maščobnih

kislin in so netopni v vodi.


KJE SE TVORIJO ŽOLČNE KISLINE IN KAKO DELUJEJO?

Žolčne kisline se sintetizirajo v jetrih; shranjujejo se v žolčniku in izločajo v tanko črevo. Delovamje – so EMULGATORJI MAŠČOB.


KATERE ŽOLČNE KISLINE POZNAŠ?HOLNO ŽK,GLIKOHOLNO ŽK


KAJ JE REKOMBINACIJA DNA?

Rekombinacija DNA je molekulsko kloniranje!


KAJ SO PLAZMIDI?

Plazmidi so večinoma krožne, lahko pa tudi LINEARNE DVOVIJAČNE molekule DNA, ki so sposobne samostojnega podvojevanja, pri bakterijah, arhejah, lahko pa tudi pri evkariontih.


KAJ SO BAKTERIOFAGI?

kompleksna oblika virusa, ki napada bakterije in so specializirani za določeno bakterijo

glava je sestavljena iz beljakovinskega ovoja, ki obdaja genetski material + REP

beljakovine iz repa prepoznajo bakterijo, na katero se bakteriofagi pritrdijo z repkom

uporabljajo jih za preprečevanje bolezni, ki jih povzročajo bakterije


KAJ JE RNK POLIMERAZA?

RNK polimeraza je encim, ki povezuje nukleotide v molekulo RNA.

KATERI NUKLEOTII SESTAVLJAJO DNA in RNA?

DNA = ADENIN – TIMIN; GVANIN – CITOZIN

RNA = ADENIN – URACIL; GVANIN – CITOZIN


KAJ JE RIBOZA IN KAJ JE DEOKSIRIBOZA ( pentozi, monomer )? V KATEREM CIKLUSU NASTAJATA?

To sta pentozi, monomera. Riboza je sladkor v ribonukleotid monosulfatu, ki je gradnik RNA. Deoksiriboza pa je sladkor v deoksiribonukleotid monofosfatu gradniku DNA. Nastajata v metaboličnem procesu GLIKOLIZE.


NAŠTEJ DVE HEKSOZI!

TO STA GLUKOZA IN FRUKTOZA.


KATERI PUFRSKI SISTEMI URAVNAVAJO pH TELESNIH TEKOČIN?

BIKARBONATNI PUFER,HEMOGLOBINSKI PUFER

PLAZEMSKI PUFER,FOSFATNI PUFER


MAKROMOLEKULE SO: DNA, HOLESTEROL, RNA, KOENCIM – A


MONOMERI SO: DEOKSIRIBOZA, GVANIN, RIBOZA, ASPARAGIN


HETEROPOLIMERI SO: DNA, KOENCIM – A,


HOMOPOLIMERI SO: GLIKOGEN,


POLARNE MOLEKULE SO: ETANOL,


ENCIMI SO: RNA,DNA,AST,ALT,ALKALNA FOSFATAZA


LIPIDI SO: VOSKI, HOLESTEROL, VITAMIN D


DNA JE V OBLIKI DVOJNE VIJAČNICE.


RNA JE SESTAVLJENA IZ RIBOZE.

DUŠIKOVE BAZE, KI TVORIJO RNA SO: ADENIN, CITOZIN, URACIL.

VERIGI DVOJNE VIJAČNICE STA POVEZANI Z KOVALENTNIMI VEZMI.

Z VODIKOVIMI VEZMI SO POVEZANE BAZE V DNA : GVANIN IN CITOZIN.

POSAMEZNA NUKLEOTIDNA VERIGA SLUŽI KOT MATRICA ZA SINTEZO SEBI ENAKE VERIGE.

DNA V ČLOVEŠKI CELICI SE NAHAJA V KROMOSOMIH.

RNA V EVKARIONTSKI CELICI SE NAHAJA V JEDRU.

RIBOSOMI SE V EVKARIONTSKI CELICI NAHAJAJO NA POVRŠINI ENDOPLAZMATSKEGA RETIKULUMA.

SINTEZA RNK POTEKA V JEDRU.

KROMATIN JE V JEDRU.

KROMOSOMI SO MOLEKULE DNA.

KROMOSOME LAHKO VIDIMO POD ELEKTRONSKIM MIKROSKOPOM.

BELJAKOVINE, KI SO POVEZANE V DNA V KROMOSOMU SO HISTONI.

PRI REPLIKACIJI DNA SODELUJEJO DNA POLIMERAZE.

PRI TRANSKRIPCIJI RNA SODELUJEJO RNA POLIMERAZE.

PRI EVKARIONTIH POTEKA REPLIKACIJA DNA V JEDRU.


EUKARIONTI SO:ŽIVALI, RASTLINE, ČLOVEK


PROKARIONTI SO:ENOCELIČNI ORGANIZMI – MODROZELENE ALGE


POSLEDICE OKVARE GENOV:CISTIČNA FIBROZA,MIŠIČNA DISTROFIJA


MISHAEL-MENTASOVA ENAČBA MED E IN S!KAKO SE SUBSTRAT VEŽE NA ENCIM?ENCIM + SUBSTRAT =ENCIM SUBSTRAT=ENCIM + PRODUKT


PUFERNI SISTEMI:BIKARBONATNI,HEMOGLOBINSKI,PLAZEMSKI,FOSFATNI


KAJ JE GEN?GEN JE SESTAVNI DEL GENOMA.SESTAVLJEN JE IZ EKSONOV=KODIRAJOČA REGIJA GENA( NOSIJO GENETSKO INFORMACIJO) IN INTRONOV=NEKODIRAJOČA REGIJA GENOV (NE NOSIJO GENETSKE INFOR.)


MLEČNOKISLINSKO VRENJE POTEKA V AEROBNEM CITRATNEM CIKLUSU.


SKUPINE ENCIMOV:HIDROLAZE-AF,OKSIDOREDUKTAZE,TRANSFERAZE-AST,ALT,LIAZE,IZOMERAZE,LIGAZE


MONOSAHARDI:FRUKTOZA,GALAKTOZA,RIBOZA,GLUKOZA,MANOZA


DISAHARIDI:SAHAROZA,LAKTOZA,MALTOZA


POLISAHARIDI:ŠKROB,CELULOZA,GLIKOGEN


VRSTE ENCIMOV NA CELICO:MEMBRANSKI-AF,CITOPLAZMATSKI-AST,ALT,ORGANELNOSPECIFIČNI 1/3AST,INKRETORNI IN SEKRETORNI-prebavni.


KEMIČNE ZNAČILNOSTI AK:DIPOLARNA IONSKA OBLIKA-Ph7,4,AMINSKA SKUPINA-pKa9,7,KARBONSKA SKUPINApKa2,3,STEREOIZOMETRIJA(L-D AK)=SUČEJO RAVNINO POLARIZACIJSKE SVETLOBE V LEVO IN DESNO.


PEPTIDI-VEČ AK POVEZANIH Z AMIDNO VEZJO


PROTEINI-POLIMERI IZ RAZLIČNIH LEVOSUČNIH AK


LIPIDI-HIDROFOBNE SPOJINE-NASIČENE IN NENASIČENE MK


KOLIKO O2 SE VEŽE NA Hb? POTEKA V 4 FAZAH

Hb+O2=Hb(O2);Hb(O2)+O2=Hb(O2)2;Hb(O2)2+O2=Hb(O2)3;Hb(O2)3+O2=Hb(O2)4


NAD=NIKOTIN ADENIN DINUKLEOTID( lahko sprejme 2e  in 1p)


HISTONI SO BELJAKOVINE, KI SO POVEZANE V DNA V KROMOSOMU.


KATABOLIZEM= osnovna kemična reakcija je OKSIDACIJA. Razgradnja (npr.maščob,glukoze),nastanejo INTERMEDIATI ( vmesni produkti ), lahko pa do končne razgradnje – nastane energija.


ANABOLIZEM= sinteza kompleksnih bioloških molekul. Osnovna kemična reakcija je REDUKCIJA, da ta poteka je potrebna E ( iz ATP )


KAJ SO ALOSTERIČNI ENCIMI?

Alosterični encimi spadajo med regulatorne encime=so velika skupina encimov, ki ne kažejo značilnosti MICHAELIS-MENTENOVE kinetike(hiperbolične krivulje hitrosti. Alosteričnost pomeni,da so sestavljeni iz več podenot pri katerih pride pri vezavi ligandov do KONFORMACIJSKIH sprememb.v celici so ti encimi odgovorni za katalizo pa tudi za uravnavanje hitrosti celotnih metaboličnih procesov

Dodaj odgovor

Vaš e-naslov ne bo objavljen. * označuje zahtevana polja